Ông Moon đã kết hôn với một ca sĩ học cùng đại học với ông là bà Kim Jung Sook (Kim Chính Thục), họ có hai người con, một trai và một gái. Ông là vị Tổng thống Hàn Quốc thứ hai theo đạo Công giáo, sau cựu Tổng thống Kim Dae-jung.[29] Tên rửa tội của ông Moon là "Timothy" (Thánh Timôthê).[30] Ông cũng được gọi là "Minh vương" (冥王, Myeong-wang hoặc myung-wang) bởi vì ông trông giống với Silvers Rayleigh, một nhân vật trong truyện tranh manga Nhật Bản nổi tiếng One Piece.[31]